Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx20Q9JJY4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx20Q9JJY4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
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