Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herpud1Q9JJK5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms