Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco4Q9JIS3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.8 ms