Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms