Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 329.6 ms