Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkrip1Q9CWV6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms