Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CR55 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CR55 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CR55 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CR55 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CR55 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CR55 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CR55 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CR55 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CR55 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CR55 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CR55 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CR55 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CR55 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CR55 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CR55 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CR55 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CR55 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CR55 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CR55 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CR55 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CR55 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CR55 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CR55 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CR55 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CR55 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CR55 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CR55 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CR55 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CR55 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CR55 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CR55 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CR55 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CR55 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CR55 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CR55 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CR55 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CR55 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CR55 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CR55 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CR55 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CR55 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CR55 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CR55 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CR55 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CR55 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CR55 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CR55 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CR55 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9CR55 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CR55 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CR55 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CR55 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CR55 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CR55 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CR55 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CR55 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CR55 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CR55 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CR55 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CR55 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CR55 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CR55 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CR55 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CR55 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CR55 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CR55 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CR55 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CR55 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CR55 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CR55 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CR55 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CR55 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CR55 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CR55 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CR55 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CR55 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CR55 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CR55 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CR55 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CR55 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CR55 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CR55 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CR55 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms