Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim3Q99PE5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms