Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sntg1Q925E1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sntg1Q925E1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sntg1Q925E1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sntg1Q925E1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sntg1Q925E1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sntg1Q925E1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sntg1Q925E1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sntg1Q925E1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sntg1Q925E1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sntg1Q925E1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sntg1Q925E1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sntg1Q925E1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sntg1Q925E1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg1Q925E1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg1Q925E1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg1Q925E1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg1Q925E1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg1Q925E1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg1Q925E1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg1Q925E1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg1Q925E1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms