Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt79Q8VED5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms