Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fndc3c1Q6DFV6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.6 ms