Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Thsd7aQ69ZU6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Thsd7aQ69ZU6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms