Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Knl1Q66JQ7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Knl1Q66JQ7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms