Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctf1Q60753 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms