Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VrtnQ3SYK4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms