Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psme1P97371 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Psme1P97371 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Psme1P97371 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Psme1P97371 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psme1P97371 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psme1P97371 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psme1P97371 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psme1P97371 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Psme1P97371 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme1P97371 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme1P97371 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psme1P97371 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psme1P97371 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psme1P97371 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psme1P97371 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psme1P97371 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Psme1P97371 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Psme1P97371 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Psme1P97371 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Psme1P97371 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Psme1P97371 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Psme1P97371 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Psme1P97371 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Psme1P97371 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Psme1P97371 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Psme1P97371 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Psme1P97371 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Psme1P97371 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Psme1P97371 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Psme1P97371 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Psme1P97371 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Psme1P97371 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Psme1P97371 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Psme1P97371 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Psme1P97371 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Psme1P97371 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Psme1P97371 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Psme1P97371 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Psme1P97371 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Psme1P97371 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Psme1P97371 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms