Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms