Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01736 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01736 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01736 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01736 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01736 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01736 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01736 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01736 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01736 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01736 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01736 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01736 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01736 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01736 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01736 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01736 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01736 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01736 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01736 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01736 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01736 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01736 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01736 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01736 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01736 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01736 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01736 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01736 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01736 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01736 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01736 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01736 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01736 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01736 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01736 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01736 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01736 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01736 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01736 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01736 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01736 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01736 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01736 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01736 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01736 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01736 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01736 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01736 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01736 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01736 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01736 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01736 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01736 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01736 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01736 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01736 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01736 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01736 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01736 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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