Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-ObO35424 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-ObO35424 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms