Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mfsd4b4J3QNS5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms