Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd60A2AMD2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd60A2AMD2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd60A2AMD2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd60A2AMD2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd60A2AMD2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd60A2AMD2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd60A2AMD2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd60A2AMD2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd60A2AMD2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd60A2AMD2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd60A2AMD2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd60A2AMD2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd60A2AMD2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ankrd60A2AMD2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms