Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trbv1A0A0B4J1G7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Trbv1A0A0B4J1G7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trbv1A0A0B4J1G7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trbv1A0A0B4J1G7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trbv1A0A0B4J1G7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trbv1A0A0B4J1G7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trbv1A0A0B4J1G7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms