Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Six6Q9QZ28 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms