Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smco4Q9JIS3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms