Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms