Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc46a3Q9DC26 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc46a3Q9DC26 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms