Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap5s1Q9D742 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms