Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx20Q9D2Y5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx20Q9D2Y5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms