Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rrbp1Q99PL5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Rrbp1Q99PL5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Rrbp1Q99PL5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 396.7 ms