Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsl24d1Q99L28 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsl24d1Q99L28 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms