Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Nlgn1Q99K10 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlgn1Q99K10 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms