Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NipblQ6KCD5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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