Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScapQ6GQT6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ScapQ6GQT6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ScapQ6GQT6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ScapQ6GQT6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms