Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cln3Q61124 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cln3Q61124 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cln3Q61124 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms