Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Trappc1Q5NCF2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc1Q5NCF2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Trappc1Q5NCF2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Trappc1Q5NCF2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Trappc1Q5NCF2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Trappc1Q5NCF2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc1Q5NCF2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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