Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU8

Bpifa6, BPI fold-containing family A, member 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa6Q0VGU8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Bpifa6Q0VGU8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bpifa6Q0VGU8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bpifa6Q0VGU8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 303 ms