Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc138Q0VF22 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc138Q0VF22 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms