Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Psme1P97371 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psme1P97371 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psme1P97371 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psme1P97371 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Psme1P97371 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Psme1P97371 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Psme1P97371 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psme1P97371 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Psme1P97371 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Psme1P97371 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psme1P97371 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psme1P97371 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms