Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfixP70257 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfixP70257 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfixP70257 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfixP70257 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NfixP70257 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfixP70257 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfixP70257 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfixP70257 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfixP70257 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfixP70257 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfixP70257 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfixP70257 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfixP70257 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfixP70257 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfixP70257 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfixP70257 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfixP70257 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfixP70257 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfixP70257 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfixP70257 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfixP70257 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfixP70257 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfixP70257 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfixP70257 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NfixP70257 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfixP70257 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfixP70257 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfixP70257 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfixP70257 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfixP70257 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfixP70257 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfixP70257 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfixP70257 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfixP70257 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfixP70257 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfixP70257 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfixP70257 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfixP70257 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfixP70257 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfixP70257 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfixP70257 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfixP70257 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfixP70257 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfixP70257 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfixP70257 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfixP70257 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfixP70257 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfixP70257 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfixP70257 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfixP70257 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfixP70257 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NfixP70257 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NfixP70257 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NfixP70257 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NfixP70257 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfixP70257 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfixP70257 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfixP70257 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfixP70257 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfixP70257 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfixP70257 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfixP70257 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfixP70257 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfixP70257 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfixP70257 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfixP70257 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfixP70257 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfixP70257 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfixP70257 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfixP70257 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfixP70257 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfixP70257 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfixP70257 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfixP70257 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfixP70257 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfixP70257 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfixP70257 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NfixP70257 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfixP70257 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfixP70257 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NfixP70257 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfixP70257 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfixP70257 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfixP70257 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfixP70257 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfixP70257 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfixP70257 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfixP70257 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NfixP70257 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfixP70257 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfixP70257 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfixP70257 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfixP70257 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfixP70257 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfixP70257 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfixP70257 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfixP70257 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfixP70257 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfixP70257 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.6 ms