Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa11P50709 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa11P50709 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa11P50709 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa11P50709 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa11P50709 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa11P50709 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa11P50709 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa11P50709 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms