Protein–RNA interactions for Protein: P25118

Tnfrsf1a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1aP25118 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf1aP25118 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf1aP25118 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms