Protein–RNA interactions for Protein: O35709

Enc1, Ectoderm-neural cortex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Enc1O35709 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Enc1O35709 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Enc1O35709 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Enc1O35709 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Enc1O35709 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Enc1O35709 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Enc1O35709 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Enc1O35709 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Enc1O35709 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Enc1O35709 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Enc1O35709 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Enc1O35709 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Enc1O35709 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Enc1O35709 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Enc1O35709 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Enc1O35709 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Enc1O35709 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Enc1O35709 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Enc1O35709 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 443.6 ms