Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20425E9Q035 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20425E9Q035 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms