Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a3A2ACT7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col9a3A2ACT7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms