Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ino80eA0A0U1RP99 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms