Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsc22d3Q9Z2S7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tsc22d3Q9Z2S7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms