Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhx6Q9R1R0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms