Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr1Q9EPQ1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr1Q9EPQ1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr1Q9EPQ1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr1Q9EPQ1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr1Q9EPQ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr1Q9EPQ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr1Q9EPQ1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr1Q9EPQ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr1Q9EPQ1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr1Q9EPQ1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr1Q9EPQ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr1Q9EPQ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr1Q9EPQ1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr1Q9EPQ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr1Q9EPQ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr1Q9EPQ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms