Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim23Q9DAL0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim23Q9DAL0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms