Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slx4ipQ9D7Y9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4ipQ9D7Y9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx4ipQ9D7Y9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms